به گزارش «باشگاه دانشجویان» ایسنا، شبیه‌سازی دینامیک مولکولی ابزاری قدرتمند برای بررسی خواص ماده، پلیمریزاسیون، طراحی داروها، مدل کردن بیومولکول‌ها و بسیاری از کاربردهای دیگر و بررسی چرایی این پدیده‌ها در ابعاد مولکولیست.
در این دوره آموزشی، مهندس الیار تورانی به مدت ۲۴ ساعت در ۶ جلسه، زیر فصل‌هایی از قبیل پیشینه‌ی شبیه سازی‌های رایانه‌ای، مفاهیم پایه‌ای شبیه‌سازی دینامیک - مولکولی و آشنایی با مدل سازی اتمی - مقدمه‌ای بر ترمودینامیک آماری، آنسامبل ها و روش های مختلف برقراری - آنسامبل‌ها(کنترل دما و کنترل فشار) - توابع انرژی پتانسیل، میدان‌های نیرو برای ذرات و مکانیک مولکولی - شرایط مرزی و شرایط اولیه‌ی سیستم - الگوریتم‌های انتگرال‌گیری از معادلت حرکت - نوشتن برنامه‌ای ساده با استفاده از پایتون یا متلب برای اجرای شبیه سازی - دینامیک مولکولی و مشاهده مشکلت برنامه نویسی - آشنایی اولیه با نرم‌افزارهای مختلف در زمینه شبیه‌سازی دینامیک - مولکولی (نصب و راه اندازی و شروع کار با مثال های ساده) - تعریف سیستم مورد مطالعه برای نرم افزار، چگونگی ورود داده‌های اولیه - نرم افزار و برقراری تعادل در سیستم - مفهوم خواص استاتیک و چگونگی به دست آوردن آن‌ها با نرم افزار- مفهوم خواص دینامیک و چگونگی به دست آوردن آن‌ها با نرم افزار - آشنایی با نرم افزار های کمکی برای ورود داده‌هایی با ساختارهای پیچیده و نمایش moltemplate, packmol, msi2lmp, atomsk, VMD لمپس - VMD, ovito, gnuplot, خروجی های لمپس با نرم افزار های مختلف ( (... , MATLAB, python - نقطه ی ،MSD محاسبه ،RDF بررسی مثال‌های مختلف(تابع توزیع شعاعی ) - برای پلیمر ها، محاسبه ی ضریب نفوذ، پارامتر حللیت، ویسکوزیته، Tg ذوب - نمودار تنش-کرنش و محاسبه ی مدول، شبیه سازی غشاها، محاسبه ی - آنتروپی، انرژی آزاد و … - حل مثال با لمپس Coarse-Graining آشنایی با مفهوم - بررسی و پیاده سازی شبیه سازی های صورت گرفته در مقالت مختلف - لمپس و پرسش سؤالت خود از متخصصان- mailing list نحوه ی استفاده از این رشته را برای دانشجویان تدریس می‌کند.
این برنامه از ۲۳ آبان، پنج شنبه ها ساعت ۱۳ تا ۱۷ در ساختمان ابوریحان برگزار می‌شود.
علاقمندان می‌توانند برای کسب اطلاعات بیشتر و ثبت نام تنها از طریق لینک http://skillcenter.aut.ac.ir/events/moleculardynamics-fall98pol اقدام کنند.
انتهای پیام
نظرات