مسجد فرط یکی از مکان‌های حضور حضرت امام رضا (ع) در گذشته بوده که به همین دلیل یکی از حجرات مسجد به "صومعه امام رضا(ع)" یا قدمگاه نام گذاری شده است.

به گزارش خبرنگار ميراث و گردشگري خبرگزاري دانشجويان ايران (ايسنا)-منطقه يزد، در مسجد فرط سنگ محرابی به اندازه 145 در 123 سانتیمتر وجود دارد که در اصل ده قطعه بوده و قسمتی ازسمت چپ آن از بین رفته و در حال حاضر 9 قطعه آن باقی مانده است.

در سه ردیف حاشیه و وسط این سنگ آیاتی از قرآن کریم کتیبه شده که این نقوش را می‌توان به قرن ششم ه. ق نسبت داد.

حجره قدمگاه این مسجد در سمت شرق آن قرار دارد و درب آن دو لنگه دارد که بر کتیبه آن سال 937 به عنوان تاریخ وقف درب نوشته شده است.

حیاط مسجد فرط محوطه ای مربعی شکل است و در قسمت جنوبی آن شبستان مسجد قرار گرفته است. این شبستان سه دهنه دارد و عرض هر کدام از دهانه ها سه متر و ستون های وسط آن ها به قطر 70 سانتی متر و ارتفاع هر کدام ازآن ها دو متر است.

مسجد فرط از کوچه دارالشفاء به صفه ای منتهی می شود که این صفه به حیاط و به قسمت گرمخانه مسجد که در ضلع شمالی حیاط واقع شده، راه دارد و تمام مصالح به کا رفته در این بنا خشت و آجر است.

از دیگر مساجد تاریخی استان می توان به جامع یزد، ابوالمعالی یزد، شاه تهماسب، ریگ یزد، حظیره، سرپلک، پیرحسین، ملا اسماعیل، شاه عبدالقیوم، چهار منار، مصلی، پشت باغ، بیاق خان، مسجد جامع خرانق، مسجد بیرون ابرکوه، مسجد جامع بافق، مسجد جامع عزآباد صدوق، مسجد جامع اردکان، مسجد جامع مهرپادین مهریز و مسجد جامع فهرج اشاره کرد.

قدمت ساختمان فعلی مسجد فرط به دوران صفویه بر می‌گردد و به شماره ثبتی 1825و در تاریخ 15/10/75 در فهرست آثار ملی کشور به ثبت رسید.