شکل‌گیری رودخانه «قمرود» در مسیر شهر قم، به مرور این شهر تاریخی را از منطقه‌ای کوچک به شهری بزرگ تبدیل کرد، خاک‌سپاری پیکر مطهر حضرت معصومه (س) در کنار رودخانه و ایجاد بارگاه و حرم برای آن حضرت هم به گسترش این شهر کمک کرد. رودخانه مسیله‌رود که صدها سال قبل با پیوستن رودخانه «قره چای» به «قره رود» شکل گرفته بود، سال‌هاست تنها نشان وجود آن فرورفتگی و شن‌های کف رودخانه است، هر چند قبل از حذف تدریجی رودخانه، روستای «مظفرآباد مسیله» به مرور در این منطقه شکل گرفت.
روستای «مظفرآباد مسیله» روستایی اعیانی بوده که محل حضور ماموران حکومتی در زمان مظفرالدین شاه برای پرداختن به امور همۀ روستاهای دشت مسیله بوده است، دشت مسیله تامین‌کننده گندم ایران مرکزی و حتی گسترده‌تر از آن بود و اکنون این روستا را می‌توان تابلویی تمام نما از تاثیر قطع حقابه‌های زیست محیطی در استان‌های بالادست در راستای مدیریت ناصحیح آب در کشور تصور کرد. در «سفرنامه صاحب جمع» این روستا را این طور تشریح کرده‌اند «خانه‌های اعیانی و مرفه این روستا در حاشیه مسیله‌رود قرار داشت، منطقه‌ای که بر فراز آن، به واسطۀ همجواری با رودخانه، صدها و هزاران درنای مهاجر قابل مشاهده بود و گله‌های آهو بهانه شکار را برای آن ماموران حکومتی در زمان استقرار و پرداختن به امور محوله فراهم می‌کرد»